Câu lạc bộ Hà Nội sẽ nằm ở bảng A, cùng Bali United - nhà vô địch giải Indonesia năm 2019, Boeung Ket Angkor của Campuchia và một thủ chưa xác định sau trận play-off. Do quy định 2 câu lạc bộ cùng quốc gia không được chung bảng, Sài Gòn được xếp vào bảng C. Thầy trò ông Vũ Tiến Thành sẽ đối đầu với Lion City của Singapore và Kedah của Malaysia, cùng một đối thủ chưa xác định.

Trong bảng đấu này, cả Hà Nội và Sài Gòn đều không phải gặp các đối thủ khó chơi. Bali United là đối thủ lớn nhất của Hà Nội nhưng đội bóng đến từ Indonesia không có thực lực mạnh. Đội bóng này từng thắng ngược 4-1 Than Quảng Ninh trong thế hơn người ở AFC Cup 2020, còn trận lượt về năm đó bị hủy do COVID-19. 

Vòng bảng AFC Cup khu vực Đông Nam Á sẽ diễn ra từ 22-28.6, thi đấu tại địa điểm tập trung và sẽ được thông báo trong thời gian tới, với điều kiện đảm bảo được những tiêu chí cơ bản liên quan đến phòng chống dịch COVID-19, cơ sở vật chất, chuyên môn...